นอกเหนือจากงานแสดง มัลลิแกนเป็นหนึ่งในนักแสดงหญิงอีกหลายคนที่ร่วม Safe Project (แต่ละคนถ่ายรูปในสถานที่ที่รู้สึกปลอดภัยที่สุด)  สำหรับซีรีส์ปี 2010 เพื่อปลุกจิตสำนึกเรื่องการค้ามนุษย์ทางเพศ [59] เธอบริจาคชุด Vionnet ที่เธอสวมไปงาน BAFTA 2010 ให้กับ Curiosity Shop เพื่อนขายและนำไปบริจาคเพื่อการกุศล[60]

มัลลิแกน ได้รับเลือกให้เป็นทูตของ Alzheimer's Society ในปี 2012 โดยมีเป้าหมายในการสร้างความตระหนักและให้ทุนวิจัยโรคสมองเสื่อมและโรคจิตเสื่อม คุณยายของเธอเป็นอัลไซเมอร์และจำเธอไมได้แล้ว [61][62] เธอช่วยจัดและเข้าร่วมงาน Memory Walk ของสมาคมนี้ในปี 2012 และเป็นหนึ่งในผู้ให้สปอนเซอร์แก่สมาคมในการ การจัดงานกึ่งมาราธอน Nike Run to the Beat  ในลอนดอน ในปี 2013[63][64]

ในปี 2014 มัลลิแกน เป็นทูตสำหรับงานการกุศล War Child และใน 2014 เธอไปเยี่ยมสาธารณรัฐคองโก[65][66]